什么是支原體核酸法

支原體核酸法包括PCR和qPCR，通過檢測(cè)支原體的特異核酸序列，以確定細(xì)胞上清或生物制品中是否存在支原體污染的一種方法。

由于支原體核酸法具有檢測(cè)時(shí)間短（只需3-4h）、操作便捷等特點(diǎn)，越來越受到生物制品企業(yè)的青睞。

支原體核酸法可作為藥典規(guī)定的培養(yǎng)法或DNA染色法的替代方法，或與以上方法相互補(bǔ)充。

事實(shí)上，早在2011年，就有動(dòng)物疫苗廠家在2011年第5期的《廣東農(nóng)業(yè)科學(xué)》上，報(bào)道了用德國Minerva Biolabs（簡(jiǎn)稱MB）公司的支原體PCR試劑盒，用于檢測(cè)疫苗中是否存在支原體的污染，它可與培養(yǎng)法互為補(bǔ)充，共同用于生產(chǎn)，為生產(chǎn)提供可靠的數(shù)據(jù)支持。

支原體標(biāo)準(zhǔn)品

方法驗(yàn)證

支原體核酸法在用于放行檢測(cè)之前，需先進(jìn)行方法驗(yàn)證。歐洲藥典和日本藥典均要求核酸法需要在靈敏度、特異性和耐用性三個(gè)指標(biāo)方面達(dá)到要求。

在靈敏度方面（又稱最di檢測(cè)限），要求核酸法替代培養(yǎng)法，則靈敏度需達(dá)到10CFU/ml；核酸法替代DNA染色法，則靈敏度需達(dá)到100CFU/ml。

 

在特異性方面，歐洲藥典和日本藥典要求，核酸法要識(shí)別的常見9種支原體，而不識(shí)別與支原體有近緣關(guān)系的菌屬，如丙酮丁醇梭菌、嗜酸乳桿菌和肺炎鏈球菌，也不識(shí)別其他細(xì)菌和哺乳動(dòng)物DNA。

在耐用性方面，歐洲藥典要求檢測(cè)結(jié)果不受方法參數(shù)的小的偏差的影響，如濃度的變化（MgCl2、引物、dNTP）、提取步驟的細(xì)微差別等。實(shí)際上這是強(qiáng)調(diào)結(jié)果的可靠性和穩(wěn)定性，不受人為操作誤差的影響。這可通過3輪不同時(shí)間段內(nèi)的檢測(cè)來實(shí)現(xiàn)，每輪進(jìn)行8次重復(fù)檢測(cè)，最后觀察結(jié)果有什么變化。

在進(jìn)行方法驗(yàn)證時(shí)，參比標(biāo)準(zhǔn)品是bi不可少的。著名微生物防控專家德國MB公司提供有一系列的支原體標(biāo)準(zhǔn)品和支原體DNA標(biāo)準(zhǔn)品，用于支原體核酸法的方法學(xué)驗(yàn)證。

 

支原體標(biāo)準(zhǔn)品

Minerva Biolabs標(biāo)準(zhǔn)品

MB提供的標(biāo)準(zhǔn)品有三類：

 

靈敏度標(biāo)準(zhǔn)品

同時(shí)也用于耐用性驗(yàn)證。該標(biāo)準(zhǔn)品為凍干粉型的滅活支原體，這樣不會(huì)造成實(shí)驗(yàn)室污染。原支原體來自英國NCTC菌種保藏中心，由于傳代次數(shù)低，也很少發(fā)生突變。支原體經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)定量，有10CFU/管和100CFU/管可選。使用時(shí)用1ml與待測(cè)樣本同樣的基質(zhì)液去溶解。之后進(jìn)行支原體DNA抽提，再進(jìn)行核酸法檢測(cè)。如結(jié)果陽性，則表明最di檢測(cè)限能達(dá)到上述標(biāo)準(zhǔn)。

 

特異性驗(yàn)證用標(biāo)準(zhǔn)品

它包括支原體基因組DNA以及細(xì)菌基因組DNA，種屬經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證。該標(biāo)準(zhǔn)品為10ng左右包裝，為凍干粉型。用于PCR和qPCR方法對(duì)支原體物種的特異性檢查,每種支原體DNA經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證，濃度經(jīng)滴度測(cè)定。

 

PCR定量標(biāo)準(zhǔn)品

該標(biāo)準(zhǔn)品是經(jīng)過嚴(yán)格定量的支原體DNA標(biāo)準(zhǔn)品，每管支原體基因組DNA的量為1×10^8基因組拷貝，用于10倍梯度稀釋制備標(biāo)準(zhǔn)曲線，以對(duì)核酸法（主要是qPCR）的檢測(cè)限進(jìn)行精確定量，并可驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品濃度對(duì)數(shù)與Ct值的線性關(guān)系。

值得指出的是，歐洲藥典和日本藥典均要求先進(jìn)行支原體DNA抽提，再進(jìn)行核酸法檢測(cè)。因此，方法驗(yàn)證實(shí)際上包括了核酸法的這兩部分。

對(duì)于生物制品、細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)企業(yè)，在選用已經(jīng)過廠家全面驗(yàn)證的支原體檢測(cè)試劑盒之外，還需自己按照待測(cè)樣本類型進(jìn)行方法的適用性驗(yàn)證。

試劑盒的驗(yàn)證并不能代替包括操作過程在內(nèi)的方法的適用性，操作、樣本基質(zhì)和儀器同樣會(huì)對(duì)核酸法的技術(shù)指標(biāo)產(chǎn)生不可忽視的影響。因此“對(duì)癥下藥”就顯得尤為重要了