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支原體PCR檢測——德國MB Venor Gem Classic使用指南

更新時間:2023-09-29  |  點擊率:449

支原體污染是細胞培養實驗中,較為常見又十分棘手的問題。日常實驗中,需要對細胞培養環境定期清潔;對細胞培養上清液、培養基和生物制藥生產環節進行的支原體污染監測。尋找一種快速、可靠和節省時間的常規監測手段對于提高實驗效率、維持實驗結果的穩定十分重要。


德國Minerva Biolabs公司生產的Venor®GeM經典試劑盒,為檢測細胞培養物和其他生物基質中支原體而設計。基于傳統PCR方法,可實現快速、穩健、高靈敏度的支原體污染檢測。

產品名稱:支原體常規PCR檢測試劑盒

英文:Venor® Gem Classic    

品牌:Minerva-Biolabs®    

貨號:11-1025

規格:25次/盒  


產品特點及原理


該試劑盒針對支原體基因組中的一個高度保守區域:16s rRNA編碼區,以檢測歐洲藥典第2.6.7章(EP 2.6.7)、日本藥典第G3章(JP G3)和更多物種中包含的所有物種,根據支原體種類的不同,擴增子的大小在265-278 bp之間。

試劑盒設計滿足EP 2.6.7和JP G3不同樣品材料(如細胞培養上清、細胞培養基、Tris緩沖液)的檢測標準。該檢測方法適用于通常用于研究的細胞培養上清、“細胞培養富集"方法或DNA提取后的支原體直接檢測。該試劑盒符合EP 2.6.7和JP G3的要求。


整個測試僅需要3小時左右的時間,并且與基于發光的酶測定、熒光染色或培養方法相比,不需要活的支原體細胞。

使用方法詳解

預處理


一、普通細胞培養物的預處理

當細胞培養達到80% - 90%的融合度時,收集樣品。細胞培養上清液非常適合支原體試驗,不需要額外的樣品制備。

細胞培養中支原體的平均滴度為10^6-10^8顆粒/ ml。在此范圍內,上清液中存在足夠數量的支原體DNA,可以成功應用PCR檢測。


1. 從細胞培養液中取100µl上清至1.5 ml反應管中。把蓋子蓋緊。

2. 將樣品上清液在95℃下孵育10分鐘(至少5分鐘)。

3.以最大轉速離心樣品。15秒的速度使細胞碎片成顆粒。

4. 直接使用2µl進行PCR,或在+2至+8°C或≤- 18°C下長期保存樣品6天。


二、.生物藥或需遵循藥典的預處理

1、樣品富集

(可根據實際情況選做)

對于樣品體積> 200µl,建議采用樣品富集的方法以獲得最佳靈敏度。請注意,樣品濃度方案只適用于完整的支原體細胞。

因此,在樣品濃縮之前,必須避免任何破壞細胞的程序(例如通過熱失活)。可直接處理200µl體積的樣品,無需樣品

濃度的一步。

① 將最多1ml樣品上清液轉移到1.5 ml反應管中。

② ≥10,000 x g離心15分鐘(或≥13,000 x g離心6分鐘),使支原體顆粒成球。

③丟棄上清,用200µl Tris緩沖液(10 mM Tris- hcl, pH 8.4)重懸小球。

④使樣品短暫旋轉,然后立即進行樣品穩定或DNA提取。


2、樣品預穩定

(可根據實驗需求選做)

細胞培養樣品可能含有高濃度的DNA酶,即使在低溫下也會降解支原體DNA。因此,我們建議采取以下步驟來穩定樣品。如果在樣品采集后立即進行DNA提取,則可以省略此步驟。


①從細胞培養液中取500µl上清轉移到1.5 ml反應管中。把蓋子蓋緊。

②樣品在95°C下孵育10分鐘。

③以最大轉速離心樣品。速度短暫(15秒),以顆粒細胞碎片。

④用樣本提取DNA。在+2至+8°C或≤- 18°C的條件下長期保存樣品,最長可保存6天。


3.DNA提取

大量證據表明,需要提取DNA才能達到比較高的靈敏度。許多DNA提取方法建立了各種各樣的樣品材料。然而,DNA提取方法必須與支原體和樣品特異性相適應。對于EP和jp兼容的測試,DNA提取方法必須與PCR試劑盒結合進行測試。我們推薦Venor®GeM樣品制備試劑盒(Cat:56 - 1010 / -1050/-1200)。該DNA提取試劑盒為此目的進行了廣泛的測試。


PCR過程


一、準備PCR試劑


二、配制反應體系


普通細胞培養物

體系包含:

14.5 µl 水

2.5 µl 10×緩沖液

2.5 µl 引物/dNTP溶液

2.5 µl 內控

1.0 µl Taq酶 (1 unit)

每個PCR管移液23µl,丟棄剩余材料,使反應混合物渦旋5秒。


生物藥或需遵循藥典的樣本

體系包含:

6.5 µl 水

2.5 µl 10×緩沖液

2.5 µl 引物/dNTP溶液

2.5 µl 內控 

1.0 µl Taq酶 (1 unit)

每個PCR管移液23µl,丟棄剩余材料,使反應混合物渦旋5秒。


三、加樣

在配制好的反應體系中,分別加入陰性(無模板對照,NTC)對照、陽性對照、樣品.


普通細胞培養物

  • 陰性對照:加入2µl PCR級水(白色帽)。

  • 樣品:加入細胞培養上清或DNA提取液2µl。

  • 陽性對照:加入2µl陽性對照DNA(綠色帽)。

  • 關閉并渦旋所有PCR管,加載PCR儀并啟動程序。


生物藥或需遵循藥典的樣本

  • 陰性對照:加入10µl PCR級水(白色帽)。

  • 樣品:加入DNA提取液10µl。

  • 陽性對照:加入2µl陽性對照DNA(綠色帽)。

  • 關閉并渦旋所有PCR管,加載PCR儀并啟動程序。


四、開始擴增

將PCR管放入PCR儀并蓋緊蓋子,按照下圖中的程序設置PCR儀,并開始程序。


五、瓊脂糖凝膠電泳與結果分析


注意事項

?由于細胞碎片對PCR反應的負面影響,不能直接使用細胞團進行檢測。細胞顆粒、胎牛血清(FCS> 5%)、疫苗、冷凍儲存和石蠟包埋樣品,在PCR前需要提取DNA。Venor®GeM經典試劑盒使用Venor®GeM樣品制備試劑盒(Cat.56-1010/-1050/-1200)進行DNA提取。提取的DNA可在+2至+8°C下保存6天。長期儲存必須在≤- 18°C。


?培養基中的青霉素或鏈霉素不抑制支原體,也不影響試驗的敏感性。


?不建議將不同批號的試劑混合使用。試劑盒中的試劑如果超過保質期,也不建議使用。


?嚴格遵守實驗操作規范。任何偏差都可能影響測試方法和結果。


?如果提取DNA,使用新鮮的細胞培養基或洗脫緩沖液作為陰性對照。


?在陰性對照和測試反應后準備陽性對照,避免交叉污染。PCR抑制可能是由樣品基質引起的,或者在提取DNA的情況下,由洗脫緩沖液引起的。因此,我們推薦Venor®GeM樣品制備試劑盒。任何其他DNA提取試劑盒都需要驗證。